LOCUS       sequence-403706-        9030 bp    DNA     circular SYN 15-DEC-2025
DEFINITION  Expresses spike-A192 in E. coli bacterial cells.
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    .
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 9030)
  AUTHORS   Phan A, Avila H, MacKay JA
  TITLE     Biomimetic SARS-CoV-2 Spike Protein Nanoparticles.
  JOURNAL   Biomacromolecules. 2023 Mar 31. doi: 10.1021/acs.biomac.2c01465.
  PUBMED    37001147
REFERENCE   2  (bases 1 to 9030)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Exported Dec 15, 2025 from SnapGene Server 8.0.1
            https://www.snapgene.com
COMMENT     SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: 
            "Biomacromolecules. 2023 Mar 31. doi: 10.1021/acs.biomac.2c01465."
COMMENT     Sequence Label: spike-A192
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..9030
                     /mol_type="other DNA"
                     /organism="synthetic DNA construct"
     primer_bind     728..747
                     /label=LacI-R
                     /note="LacI, reverse primer"
     promoter        complement(767..844)
                     /gene="lacI"
                     /label=lacI promoter
     primer_bind     1050..1069
                     /label=pBRrevBam
                     /note="pBR322 vectors, tet region, downstream of BamHI, 
                     reverse primer"
     primer_bind     1153..1172
                     /label=T7
                     /note="T7 promoter, forward primer"
     promoter        1153..1171
                     /label=T7 promoter
                     /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"
     protein_bind    1172..1196
                     /label=lac operator
                     /bound_moiety="lac repressor encoded by lacI"
                     /note="The lac repressor binds to the lac operator to 
                     inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be 
                     relieved by adding lactose or 
                     isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."
     RBS             1211..1233
                     /note="efficient ribosome binding site from bacteriophage 
                     T7 gene 10 (Olins and Rangwala, 1989)"
     CDS             4875..4907
                     /codon_start=1
                     /product="HSV (herpes simplex virus) epitope tag"
                     /label=HSV tag
                     /translation="QPELAPEDPED"
     CDS             4914..4931
                     /codon_start=1
                     /product="6xHis affinity tag"
                     /label=6xHis
                     /translation="HHHHHH"
     primer_bind     complement(4984..5002)
                     /label=T7 Term
                     /note="T7 terminator, reverse primer"
     terminator      4998..5045
                     /label=T7 terminator
                     /note="transcription terminator for bacteriophage T7 RNA 
                     polymerase"
     rep_origin      5082..5537
                     /direction=RIGHT
                     /label=f1 ori
                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 
                     indicates direction of (+) strand synthesis"
     primer_bind     complement(5169..5188)
                     /label=F1ori-R
                     /note="F1 origin, reverse primer"
     primer_bind     5379..5400
                     /label=F1ori-F
                     /note="F1 origin, forward primer"
     promoter        5563..5667
                     /gene="bla"
                     /label=AmpR promoter
     CDS             join(5668..5736,5737..6528)
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /product="beta-lactamase"
                     /label=AmpR
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     primer_bind     complement(5886..5905)
                     /label=Amp-R
                     /note="Ampicillin resistance gene, reverse primer"
     rep_origin      6699..7287
                     /direction=RIGHT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
     primer_bind     7188..7207
                     /label=pBR322ori-F
                     /note="pBR322 origin, forward primer"
     primer_bind     7441..7458
                     /label=L4440
                     /note="L4440 vector, forward primer"
     misc_feature    7473..7612
                     /label=bom
                     /note="basis of mobility region from pBR322"
     primer_bind     complement(7538..7557)
                     /label=pRS-marker
                     /note="pRS vectors, use to sequence yeast selectable 
                     marker"
     primer_bind     7698..7720
                     /label=pGEX 3'
                     /note="pGEX vectors, reverse primer"
     CDS             complement(7714..7905)
                     /codon_start=1
                     /gene="rop"
                     /product="Rop protein, which maintains plasmids at low copy
                     number"
                     /label=rop
                     /translation="MTKQEKTALNMARFIRSQTLTLLEKLNELDADEQADICESLHDHA
                     DELYRSCLARFGDDGENL"
     CDS             complement(join(8714..9030,1..766))
                     /codon_start=1
                     /gene="lacI"
                     /product="lac repressor"
                     /label=lacI
                     /note="The lac repressor binds to the lac operator to 
                     inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be 
                     relieved by adding lactose or 
                     isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."
                     /translation="MKPVTLYDVAEYAGVSYQTVSRVVNQASHVSAKTREKVEAAMAEL
                     NYIPNRVAQQLAGKQSLLIGVATSSLALHAPSQIVAAIKSRADQLGASVVVSMVERSGV
                     EACKAAVHNLLAQRVSGLIINYPLDDQDAIAVEAACTNVPALFLDVSDQTPINSIIFSH
                     EDGTRLGVEHLVALGHQQIALLAGPLSSVSARLRLAGWHKYLTRNQIQPIAEREGDWSA
                     MSGFQQTMQMLNEGIVPTAMLVANDQMALGAMRAITESGLRVGADISVVGYDDTEDSSC
                     YIPPLTTIKQDFRLLGQTSVDRLLQLSQGQAVKGNQLLPVSLVKRKTTLAPNTQTASPR
                     ALADSLMQLARQVSRLESGQ"
ORIGIN
        1 cgcgcattgc gcccagcgcc atctgatcgt tggcaaccag catcgcagtg ggaacgatgc
       61 cctcattcag catttgcatg gtttgttgaa aaccggacat ggcactccag tcgccttccc
      121 gttccgctat cggctgaatt tgattgcgag tgagatattt atgccagcca gccagacgca
      181 gacgcgccga gacagaactt aatgggcccg ctaacagcgc gatttgctgg tgacccaatg
      241 cgaccagatg ctccacgccc agtcgcgtac cgtcttcatg ggagaaaata atactgttga
      301 tgggtgtctg gtcagagaca tcaagaaata acgccggaac attagtgcag gcagcttcca
      361 cagcaatggc atcctggtca tccagcggat agttaatgat cagcccactg acgcgttgcg
      421 cgagaagatt gtgcaccgcc gctttacagg cttcgacgcc gcttcgttct accatcgaca
      481 ccaccacgct ggcacccagt tgatcggcgc gagatttaat cgccgcgaca atttgcgacg
      541 gcgcgtgcag ggccagactg gaggtggcaa cgccaatcag caacgactgt ttgcccgcca
      601 gttgttgtgc cacgcggttg ggaatgtaat tcagctccgc catcgccgct tccacttttt
      661 cccgcgtttt cgcagaaacg tggctggcct ggttcaccac gcgggaaacg gtctgataag
      721 agacaccggc atactctgcg acatcgtata acgttactgg tttcacattc accaccctga
      781 attgactctc ttccgggcgc tatcatgcca taccgcgaaa ggttttgcgc cattcgatgg
      841 tgtccgggat ctcgacgctc tcccttatgc gactcctgca ttaggaagca gcccagtagt
      901 aggttgaggc cgttgagcac cgccgccgca aggaatggtg catgcaagga gatggcgccc
      961 aacagtcccc cggccacggg gcctgccacc atacccacgc cgaaacaagc gctcatgagc
     1021 ccgaagtggc gagcccgatc ttccccatcg gtgatgtcgg cgatataggc gccagcaacc
     1081 gcacctgtgg cgccggtgat gccggccacg atgcgtccgg cgtagaggat cgagatctcg
     1141 atcccgcgaa attaatacga ctcactatag gggaattgtg agcggataac aattcccctc
     1201 tagaaataat tttgtttaac tttaagaagg agatatacat atgcgggtgc agcccaccga
     1261 atccatcgtg cggttcccca atatcaccaa tctgtgcccc ttcggcgagg tgttcaatgc
     1321 caccagattc gcctctgtgt acgcctggaa ccggaagcgg atcagcaatt gcgtggccga
     1381 ctactccgtg ctgtacaact ccgccagctt cagcaccttc aagtgctacg gcgtgtcccc
     1441 taccaagctg aacgacctgt gcttcacaaa cgtgtacgcc gacagcttcg tgatccgggg
     1501 agatgaagtg cggcagattg cccctggaca gacaggcaag atcgccgact acaactacaa
     1561 gctgcccgac gacttcaccg gctgtgtgat tgcctggaac agcaacaacc tggactccaa
     1621 agtcggcggc aactacaatt acctgtaccg gctgttccgg aagtccaatc tgaagccctt
     1681 cgagcgggac atctccaccg agatctatca ggccggcagc accccttgta acggcgtgga
     1741 aggcttcaac tgctacttcc cactgcagtc ctacggcttt cagcccacaa atggcgtggg
     1801 ctatcagccc tacagagtgg tggtgctgag cttcgaactg ctgcatgccc ctgccacagt
     1861 gtgcggccct aagaaaagca ccaatctcgt gaagaacaaa tgcgtgaact tcggtgttcc
     1921 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     1981 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     2041 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     2101 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     2161 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     2221 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     2281 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     2341 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     2401 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     2461 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     2521 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     2581 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     2641 gggcgctgga gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     2701 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     2761 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     2821 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     2881 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     2941 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     3001 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     3061 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     3121 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     3181 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     3241 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     3301 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     3361 gggcgctgga gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     3421 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     3481 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     3541 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     3601 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     3661 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     3721 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     3781 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     3841 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     3901 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     3961 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     4021 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     4081 gggcgctgga gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     4141 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     4201 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     4261 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     4321 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     4381 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     4441 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     4501 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     4561 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc
     4621 gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc
     4681 aggtgccggt gttccgggtg ctggtgttcc gggcgctggt gtaccaggtg caggtgtgcc
     4741 tggtgccggc gtacctggcg caggtgtccc aggtgccggt gttccgggtg ctggttactg
     4801 ataatgatct tcaggatccg aattcgagct ccgtcgacaa gcttgcggcc gcactcgaga
     4861 tcaaacgggc tagccagcca gaactcgccc cggaagaccc cgaggatgtc gagcaccacc
     4921 accaccacca ctgagatccg gctgctaaca aagcccgaaa ggaagctgag ttggctgctg
     4981 ccaccgctga gcaataacta gcataacccc ttggggcctc taaacgggtc ttgaggggtt
     5041 ttttgctgaa aggaggaact atatccggat tggcgaatgg gacgcgccct gtagcggcgc
     5101 attaagcgcg gcgggtgtgg tggttacgcg cagcgtgacc gctacacttg ccagcgccct
     5161 agcgcccgct cctttcgctt tcttcccttc ctttctcgcc acgttcgccg gctttccccg
     5221 tcaagctcta aatcgggggc tccctttagg gttccgattt agtgctttac ggcacctcga
     5281 ccccaaaaaa cttgattagg gtgatggttc acgtagtggg ccatcgccct gatagacggt
     5341 ttttcgccct ttgacgttgg agtccacgtt ctttaatagt ggactcttgt tccaaactgg
     5401 aacaacactc aaccctatct cggtctattc ttttgattta taagggattt tgccgatttc
     5461 ggcctattgg ttaaaaaatg agctgattta acaaaaattt aacgcgaatt ttaacaaaat
     5521 attaacgctt acaatttagg tggcactttt cggggaaatg tgcgcggaac ccctatttgt
     5581 ttatttttct aaatacattc aaatatgtat ccgctcatga gacaataacc ctgataaatg
     5641 cttcaataat attgaaaaag gaagagtatg agtattcaac atttccgtgt cgcccttatt
     5701 cccttttttg cggcattttg ccttcctgtt tttgctcacc cagaaacgct ggtgaaagta
     5761 aaagatgctg aagatcagtt gggtgcacga gtgggttaca tcgaactgga tctcaacagc
     5821 ggtaagatcc ttgagagttt tcgccccgaa gaacgttttc caatgatgag cacttttaaa
     5881 gttctgctat gtggcgcggt attatcccgt attgacgccg ggcaagagca actcggtcgc
     5941 cgcatacact attctcagaa tgacttggtt gagtactcac cagtcacaga aaagcatctt
     6001 acggatggca tgacagtaag agaattatgc agtgctgcca taaccatgag tgataacact
     6061 gcggccaact tacttctgac aacgatcgga ggaccgaagg agctaaccgc ttttttgcac
     6121 aacatggggg atcatgtaac tcgccttgat cgttgggaac cggagctgaa tgaagccata
     6181 ccaaacgacg agcgtgacac cacgatgcct gcagcaatgg caacaacgtt gcgcaaacta
     6241 ttaactggcg aactacttac tctagcttcc cggcaacaat taatagactg gatggaggcg
     6301 gataaagttg caggaccact tctgcgctcg gcccttccgg ctggctggtt tattgctgat
     6361 aaatctggag ccggtgagcg tgggtctcgc ggtatcattg cagcactggg gccagatggt
     6421 aagccctccc gtatcgtagt tatctacacg acggggagtc aggcaactat ggatgaacga
     6481 aatagacaga tcgctgagat aggtgcctca ctgattaagc attggtaact gtcagaccaa
     6541 gtttactcat atatacttta gattgattta aaacttcatt tttaatttaa aaggatctag
     6601 gtgaagatcc tttttgataa tctcatgacc aaaatccctt aacgtgagtt ttcgttccac
     6661 tgagcgtcag accccgtaga aaagatcaaa ggatcttctt gagatccttt ttttctgcgc
     6721 gtaatctgct gcttgcaaac aaaaaaacca ccgctaccag cggtggtttg tttgccggat
     6781 caagagctac caactctttt tccgaaggta actggcttca gcagagcgca gataccaaat
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     6901 acatacctcg ctctgctaat cctgttacca gtggctgctg ccagtggcga taagtcgtgt
     6961 cttaccgggt tggactcaag acgatagtta ccggataagg cgcagcggtc gggctgaacg
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